2004年，教育部启动“985工程”二期，厦门大学“嘉庚化学科技创新平台”被列为一类科技创新平台。“嘉庚化学科技创新平台”下分设化学基础、化学材料、能源化学和化学生物学四个分平台，化学生物学作为四个分平台之一，获得了重要支持。同时，随着化学化工学院新教学科研大楼（卢嘉锡楼）的落成并投入使用，化学生物学平台得以以高起点建设。
现在，通过公开招标，化学生物学平台已建成面积2000 m2，仪器设备价值总值达3000余万元的科研教学公用仪器平台。包括：
借助十一五“211工程”和“985工程”二、三期，实验室先后购置流式细胞仪、激光共聚焦荧光显微镜、400兆核磁共振仪、DNA/RNA 合成仪、时间分辨荧光光谱仪、实时荧光定量PCR仪、生物信息学平台（包括计算机集群、数据存储、服务器、软件）等。2010年，学校已批准成立具有国际先进水平的厦门大学高场核磁共振研究中心，在“985工程三期”的支持下，购置三台液体核磁共振谱仪，分别是850兆、600兆、500兆。
化学生物学公共仪器平台的建设，将为化学、生物学、医学、药学等领域的深层次交叉与合作研究提供重要的平台技术支撑。
